Marcus Astvald gjorde matchens enda mål i andra halvleken.
Yxhult har tre segrar och och två förluster på de senaste fem matcherna, medan Stenungsund har två vinster och och tre förluster. Förlusten var Stenungsunds tredje uddamålsförlust.
För Yxhult gör resultatet att laget nu ligger på tredje plats i tabellen, medan Stenungsund är på elfte plats.
I nästa match möter Stenungsund Herrestad hemma på onsdag 25 maj 19.00.